About us
Plant research uses interdisciplinary approaches to understand the mechanisms of plant physiology, growth and productivity. High-throughput and targeted methods are used to generate large amounts of data from genomics, transcriptomics and other areas. To utilise this data effectively, research data management (RDM) according to the FAIR principles, data sharing and scientific collaboration are crucial. DataPLANT supports plant research through an open model that provides robust and accessible RDM practices and tools. A central element is the Annotated Research Context (ARC), which integrates relevant research and metadata into FAIR-compliant digital objects. In addition, the PLANTdataHUB cloud platform facilitates data exchange, publication and collaborative data management.
DataPLANT promotes the plant research data community through training activities and the provision of a data management plan wizard. The aim is to achieve broad participation in NFDI, focussing on interoperability and integration of existing datasets. DataPLANT is also working with other NFDI consortia to develop common standards and best practices for data processing and quality control. Automation and community involvement will ensure the sustainability of DataPLANT services and support the creation of high-quality data publications.
Goals
DataPLANT is data-centred and builds on existing structures. A fundamental element for achieving the goal is the Annotated Research Context (ARC), which acts as an entry point and will define the structure of a data publication in the subject area in the future. The ARC covers the entire research cycle, from the experiment to the computational aspects to the actual data and metadata as well as the resulting publications. It is based on existing formats, terminologies and guidelines, so that the integration of existing data into existing repositories can take place as smoothly as possible. A range of tools and services are available to ensure a quick start to improved data management right from the start. At the same time, the technical infrastructure for the shared use and versioning of ARCs has been established. Accordingly, DataPLANT is the central point of contact for researchers in the field of basic plant research in RDM matters.
Task Areas
Dr. Dirk von Suchodoletz
Speaker of the consortium
(Co-)applicant institutions and (co-)speakers:
- Professor Dr. Björn Usadel – Forschungszentrum Jülich
- Dr. Jens Krüger – Eberhard Karls Universität Tübingen
- Professor Dr. Timo Mühlhaus – Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
University of FreiburgFreiburg
Applicant institution
Participating Institutions
- Prof. Dr. Rolf Backofen – Bioinformatik, Albert-Ludwigs Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Olaf Brandt – Leiter der IT-Abteilung, Universitätsbibliothek, Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andrea Bräutigam – Computational Biology, Universität Bielefeld
- Dr. Dominik Brilhaus – CEPLAS Cluster of Excellence on Plant Sciences Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefan Deßloch – Heterogene InformationssystemeRheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Alisdair Fernie – Zentraler Metabolismus Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie
- Prof. Dr. Christoph Garth – Wissenschaftliche Visualisierung Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Björn Grüning – Bioinformatik Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Prof. Dr. Eric Kemen – Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP) Eberhard-Karls-Universität Tübingen
- Prof. Dr. Dr. hc. Edda Klipp – Theoretische Biophysik Humboldt-Universität zu Berlin
- Oliver Kohl-Frey – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Ute Krämer – Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen Ruhr-Universität Bochum
- Matthias Landwehr – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Dario Leister – Biozentrum der LMU München Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU)
- Prof. Dr. Heike Leitte – Visuelle Informationsananalyse Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Klaus F.X. Mayer – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB) Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
- Prof. Dr. Sven Nahnsen – Zentrum für Quantitative Biologie Eberhard Karls Universität Tübingen
- Dr. Anja Oberländer – Leiterin Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Dr. Klaus Rechert – Verwaltungs- und Wirtschaftsinformatik Hochschule für öffentliche Verwaltung Kehl
- Prof. Dr. Ralf Reski – Pflanzenbiotechnologie Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Dr. Inga Scheler – Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Karl Schmid – Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik Universität Hohenheim
- Jun. Prof. Dr. Sandra Schmöckel – Physiologie der Ertragsstabilität Universität Hohenheim
- Dr. Uwe Scholz – Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)
- Prof. Dr. Waltraud Schulze – Systembiologie der Pflanze Universität Hohenheim
- Prof. Dr. Thomas Walter – Rechenzentrum Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andreas P.M. Weber – Biochemie der Pflanzen Heinrich Heine Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefanie Weidtkamp-Peters – Center for Advanced Imaging Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
Dr. Dirk Suchodoletz
Speaker of the consortium
University of FreiburgFreiburg
Applicant institution
(Co-)applicant institutions and (co-)speakers:
- Professor Dr. Björn Usadel – Forschungszentrum Jülich
- Dr. Jens Krüger – Eberhard Karls Universität Tübingen
- Professor Dr. Timo Mühlhaus – Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
Participating Institutions
- Prof. Dr. Rolf Backofen – Bioinformatik, Albert-Ludwigs Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Olaf Brandt – Leiter der IT-Abteilung, Universitätsbibliothek, Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andrea Bräutigam – Computational Biology, Universität Bielefeld
- Dr. Dominik Brilhaus – CEPLAS Cluster of Excellence on Plant Sciences Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefan Deßloch – Heterogene InformationssystemeRheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Alisdair Fernie – Zentraler Metabolismus Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie
- Prof. Dr. Christoph Garth – Wissenschaftliche Visualisierung Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Björn Grüning – Bioinformatik Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Prof. Dr. Eric Kemen – Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP) Eberhard-Karls-Universität Tübingen
- Prof. Dr. Dr. hc. Edda Klipp – Theoretische Biophysik Humboldt-Universität zu Berlin
- Oliver Kohl-Frey – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Ute Krämer – Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen Ruhr-Universität Bochum
- Matthias Landwehr – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Dario Leister – Biozentrum der LMU München Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU)
- Prof. Dr. Heike Leitte – Visuelle Informationsananalyse Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Klaus F.X. Mayer – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB) Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
- Prof. Dr. Sven Nahnsen – Zentrum für Quantitative Biologie Eberhard Karls Universität Tübingen
- Dr. Anja Oberländer – Leiterin Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Dr. Klaus Rechert – Verwaltungs- und Wirtschaftsinformatik Hochschule für öffentliche Verwaltung Kehl
- Prof. Dr. Ralf Reski – Pflanzenbiotechnologie Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Dr. Inga Scheler – Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Karl Schmid – Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik Universität Hohenheim
- Jun. Prof. Dr. Sandra Schmöckel – Physiologie der Ertragsstabilität Universität Hohenheim
- Dr. Uwe Scholz – Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)
- Prof. Dr. Waltraud Schulze – Systembiologie der Pflanze Universität Hohenheim
- Prof. Dr. Thomas Walter – Rechenzentrum Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andreas P.M. Weber – Biochemie der Pflanzen Heinrich Heine Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefanie Weidtkamp-Peters – Center for Advanced Imaging Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf